فایل GIF کانال Alpha داره، ولی فقط 1 بیت. پیکسل ها یا دارای آلفا هستند یا فاقد آلفا. توجه داشته باشید که اگه سایز GIF شما کوچیک باشه (مثلاً 60 پیکسل در 60 پیکسل) حاشیه محلی که آلفا داره خیلی زشت و نقطه نقطه به نظر میاد.
و اما در مورد اینکه چرا مدیا انکودر براتون پشت صحنه میسازه، دلیلش اینه که یه تنظیم پیش فرضی رو در ساخت GIF انیمیت شده استفاده میکنه و به شما هم اجازه تغییرات کافی رو توش نمیده.
باید از مدیا انکودر یا هر نرم افزار دیگه ای، یک ویدیو با کانال آلفا بگیرید (مثلاً Quicktime Mov با کدک Animation) بعد به Photoshop یا هر نرم افزار GIF سازی دیگری ببرید که هنگام خروجی گرفتن بهتون امکان انتخاب و استفاده از Alpha channel رو توی خروجی میده
توی فتوشاپ ویدیو های quitime mov رو میتونی مثل یک عکس معمول باز کنید، بعد از منوی file زیرمنوی Export گزینه save for web رو بزنید و از لیست فرمت های خروجی GIF ای رو انتخاب کنید که تصویر شما رو کمتر خراب میکنه، گزینه Transparency رو هم فعال کنید و در پایین منو هم در صورت نیاز، حالت Animation را روی Lopp برای تکرار مداوم و یا تعداد تکرار مورد نظر تنظیم کرده، کلید Save را بزنید.